Η θεραπεία κρουστικών κυμάτων μπορεί να έχει ορισμένες παρενέργειες. Η θεραπεία κρουστικών κυμάτων συνήθως χρησιμοποιεί ισχυρά κύματα αέρα για να επιτύχει θεραπευτικά αποτελέσματα. Κατά τη διάρκεια της θεραπείας, μπορεί να οδηγήσει σε νεφρική βλάβη, δευτερογενείς πέτρες στον ουρητήρα και διαστολή του ουρητήρα. Μερικοί ασθενείς μπορεί επίσης να εμφανίσουν τοπική ερυθρότητα ιστού, υποδόρια αιμορραγία, μώλωπες, πόνο και άλλα συμπτώματα. Ωστόσο, η συντριπτική πλειονότητα των περιπτώσεων είναι παροδικές και σταδιακά θα βελτιωθεί μετά από 1-2 ημέρες θεραπείας. Συνιστάται στους ασθενείς να μην ανησυχούν πολύ, να ακολουθούν τις οδηγίες του γιατρού, να λαμβάνουν έγκαιρη θεραπεία και να ελέγχουν την κατάστασή τους.